不在一神论和三位一体的层次上，而主要是在救恩论的层次上。
1. 更正教接受大公信经，所以在一神论和三位一体的层次上与天主教和东正教没有区别。
2. 更正教的人论和罪论是按奥古斯丁 (Augustine) 的观点，即人是失落的，不能自救，全靠神的恩典、预定和维护，人才能得救；不象天主教在中世纪逐渐采取的伯拉纠 (Pelagian) 主义，或半伯拉纠主义观点，即人是良善的，可以行功德，并因寻求神而得救。
3. 更正教认为教会的最高权威是唯独圣经，不是教会的遗传或解释；人得救是凭着唯独信心、唯独恩典、唯独基督，而不需加上功德、礼仪、或圣母马利亚；人与神之间是有直接个人关系，不需教士或教皇作中介，人人皆祭司；
4. 更正教屏斥天主教的以下错误：拜圣母、封圣徒、拜圣像、拜圣物、炼狱说、卖赎罪券、弥撒制度（若教会禁止人参加弥撒人就没有救恩）、和变质说（领圣餐时饼和酒真的变质，成为基督的身体和血，从而基督再次受难献祭）。