由于唯物哲学以及自然主义的猖獗，灵魂不朽说，乃受到打击。他们以为心灵没有独立的，实质的，真正的存在。自启蒙运动以后，由于所谓经验主义的科学的人生观之勃兴；这种思想，先后经过了休谟、康德、达尔文等学说的影响，便加强发展，一味遵照呆板的自然法，来机械地解释整个宇宙现象，以及人类的宗教、道德、心灵问题。我国首领，中了这种思想之毒，从而不信灵魂不朽之说。例如党国元老吴稚晖先生，当时新文化运动的首领胡适之尊他为人生观大论战战线上的「押阵大将」，和领导「科学的人生观」的先锋。吴氏说：「人便是外面只剩两只脚，却得到了两只手，内面有三斤二两脑髓，五千零四十八根脑筋，比较只有多额神经系质的动物……。人只有质力，一切情感、思想、意志，都不过是质力的反应；仅勉强美其名曰心理，神其事曰灵魂。」所以他主张，「那种骇得煞人的显赫的名词，上帝阿！神阿！还是取消了好……开除了上帝的名额！放逐了精神元素的灵魂！」其次乃为新文化运动首领，中央研究院院长胡适之先生，在他所著的《胡适文选自序——介绍我自己的思想》中说：「我不信灵魂不朽之说，也不信天堂地狱之说。」「故我说，我这个小我，会死灭的。死灭是一切生物的普遍现象，不足怕，也不足惜。」「生命本身 ，不过是一件生物学的事实，有什么意义可说，生一个人，与生一只狗、一只猫，有什么分别？」吴、胡二氏，都是望重一时，他们都否认灵魂与灵魂不朽说，乃是因为中了近代唯物哲学之毒，而他们的言论乃大大影响了国人的思想，为唯物共党铺路。
许多学者，不信灵魂不朽，异想天开，张冠李戴，加以曲解。国人常以「立德」、「立言」、「立功」，视为「三不朽」，藉以自慰自豪。近人也倡所谓「种族不朽说」、「声望不朽说」以及「感力不朽说」，拿来取代灵魂不朽说。经云：「有一条路人以为正，至终成为死亡之路！」（箴一四12，一六25）他们这样的自高自大，自负自义，自我陶醉，乃等于画饼充饥，不能取代「永生之道」，不信之人的结局，照主耶稣所说，乃与信徒不同，乃是「复活定罪」（约五24）。「若有人名字没有记在生命册上的，就被扔在火湖里」，「就是第二次的死」，乃是永死，不是永生（参启二○11一15，二一8）。
兹将上述三种曲解灵魂不朽说的谬见分论如次。
1．种族不朽说——这一派的人自我陶醉，以为他虽要离开世界，但是他的后裔，子子孙孙要继续传种接代；他既生了他们，便是他的贡献，有分于他后代的生命，那就要藉着他们，永永远远一同活下去。但是这种要藉着他子孙一同活下去的痴心妄想，丝毫不能取代个人灵魂不朽说；且复完全违反圣经的教训，而事实上他的子孙也要死亡，不能救他脱离灭亡的命运，得到不朽的灵魂、永远的生命，而乃要同归于尽！
2．声望不朽说——照实证主义（Positivism）的说法，此乃唯一人当渴望追求的不朽之道。但是这种主观的想望，不但完全不合圣经的道理，而且在事实上纵使能自勉自励，博得一时的声望，甚至建立丰功伟业，可是古人咏叹说：「固一世之雄也，而今安在哉？！」虽或他们的名字，记在历史里面，即或诚如其言，能够「留芳百世」，但仍不免被人遗忘。所罗门王很感慨的说：「已过的世代，无人记念；将来的世代，后来的人也不记念。我传道者虽在耶路撒冷作过以色列的王。我专心用智慧寻求查究天下所作的一切事，乃知上帝叫世人所经练的，是极重的劳苦。我见日光之下所作的一切事，都是虚空，都是捕风。」（传一11一14）尤有进者，世人更应惊觉，照圣经所说：「若有人名字没记在生命册上的，就被扔在火湖里。」（启二○11一15）则他的声望名誉，实无补于他的永远沉沦，岂不哀哉！
3．感力不朽说——此与上述的「声望不朽说」乃有很密切的关系。但是所谓感力，不能一概而论，胥视其所作所为的动机是否为主而作。使徒保罗、奥古斯丁、路德、加尔文，以及许许多多忠心的主仆，不但冒险犯难，坚苦卓绝，甚至为道殉难，视死如归，自足彪炳千秋。但是历史上有许多所谓伟大的人物，轰轰烈烈、威震八方、气盖万世；其所作为，却乃祸国殃民，误尽苍生，民怨沸腾，恨不得寝其皮而食其肉，成为千古的罪人。所以「感力不朽说」和「灵魂不朽」绝不能混为一谈，更不能取代「灵魂不朽说」。此说既与上述的「声望不朽说」有密切的关系，则上文批判此说的理由，乃都可援引，故不复赘。
现在唯物论的宇宙观，已被学者所驳斥，而代以属灵的宇宙观。美国心理学家詹姆士（William James）说，传统的公式，以为思想乃是脑髓的功能，这种科学家的结论，乃是根据一种错觉而来，照这种公式，就以为脑的功能乃是产生的（Productive），而不知也是传达的（Transmissive）。脑髓可能仅仅传达的，正如颜色眼镜、分光镜、折射镜能够传达光，也能决定颜色与方向那样。又如光可离眼镜和透视镜等而独立，思想也可离脑髓而独立。因此詹氏说，如果误以思想为脑髓的功能，不信不朽之说；但倘能知思想乃可离脑髓而独立，便能相信灵魂之不朽。现在有些进化论者，根据他们适者生存的道理，也相信不朽说。还有些著名的科学家如上述之詹姆士，还有洛奇爵士（Sir Oliver Lodge）、希斯洛（James H. Hyslop）都很重视人死后的问题，且都信灵魂不朽；尤以洛奇爵士，乃为虔诚信徒，尝于一九一○年著《理性与信仰》（Reason & Belief）一书。在其去世前十年，本其多年对于心灵的研究，力倡死后灵魂不朽之说，发表三部著作：一为《生与死》（Life & Death）；二为《科学与永生》，（Science & Immortality）；三为《我为什么相信永生》（Why I Believe in Personal Immortality），引起了学术界极大的注意。洛氏深信灵魂不朽乃为千真万确的事实，曾撰「灵魂不朽之科学论证」一文。美国杜克大学（Duke University）在莱应博士（Dr. J. B. Rhine）领导之下，经过三百多万次测验，具体证明，人类灵命，超越时空，乃是不朽的！