上帝要救普世人類，則在漫長的人類歷史行程中，上帝必寬容忍耐，運行他的普通恩典，限製罪惡勢力的發展，使世人仍能保持若干真善美的意識，做美善的事，並求社會文化的發展，崇禮守法，不致相吞相殘，淪為禽獸。上帝複要把他豐豐富富的恩典，澆灌一切世人，不分善惡，一視同仁，使人不致立刻滅亡，俾有機會悔改得救。神學家霍祺博士（Dr. Charles Hodge）說︰「上帝所要拯救的人類裡面一部分所被揀選的人，他們乃和其余未被揀選的世人，生在同一社會裡面，而且世代相承，則對于其他未被揀選的世人，若不藉普通恩典的運行，影響其德性，俾能和平共存，則不能達到其得救的目的。」
但是關于特殊恩典和普通恩典的關系，若細加推究，其間乃有各種問題，茲分論之︰
1．兩者分別，性質如何──阿敏念派，認為兩者並無本質的不同，僅有程度的差別，因為他們以為普通恩典亦能使人聽從福音，所以兩者都有救贖的性質。普通恩典乃可助人悔改皈信；特殊恩典則能使人有悔改皈信意志。但是兩者都可被人拒絕，所以特殊恩典也未必能使人得救。
改正宗神學家卻認為兩者乃有本質的不同。特殊恩典乃是超凡的，屬靈的，力能消除罪惡的敗壞，撤銷懲罰的判決。普通恩典不是超凡的，乃是平常的，不能消除罪惡，不能使人得救，雖和特殊救恩有若干關系，但僅能限製罪惡的發展，能令人做外表的善事，改進道德，崇尚禮義，並且有助社會、文化、科學、藝術的發展，但終不能拯救罪人。所以在今世的事上，二者確有密切關系；但究有本質的不同，非僅程度的差別。無論普通恩典如何豐富，絕不能引罪人到主耶穌基督裡面，得到新的永遠的生命。
2．兩者相較何者為主──此可分兩點來講︰（a）從俗世的事來看，似難分兩者的先后主從，創世記第三章所啟示我們的，從始祖墮落以后，兩者都一同開始運行。（b）但從論理的觀點來說，則應以特殊恩典為主，普通恩典為從。
3．普通恩典是否獨立──從主耶穌基督救贖工作的觀點來看，無疑的上帝乃運用普通恩典來從旁推助他的計劃，一方面是為他被揀選的子民的生活，一方面是為教會的發展。但除此以外，普通恩典，乃有其獨特的目的，乃是專為啟發人類，並使宇宙間一切隱藏的力量都被運用，造福人類，俾人類能充分發展其才智和能力，達成其「治理這地」，「管理」萬物（參創一28）的神聖使命，以榮耀上帝、造物之主。
4．兩者是否各有領域──此應從各種觀點來說︰（a）從某種意義來說，有組織的教會乃為特殊恩典運行的領域；但誠如上節所說，上帝亦運行普通恩典，從旁推助。（b）兩者都在世界運行，但普通恩典的領域乃為自然界和屬于今世的事，而特殊恩典則乃特別關乎他新造的子民。可是兩者仍是可以發生彼此的影響。（c）普通恩典固可使教會得更豐盛的福祉；但是特殊恩典卻能提高普通恩典果效的程度，使受到重生的生命的影響。
這兩種恩典的分別，可從四點來說︰
1．僅限于被揀選的──特殊恩典乃根據上帝的天命，僅限于他所揀選的，乃是「照他自己所預定的美意」，「從創立世界以前，在基督裡揀選了我們」（參弗一3一10）。普通恩典，則不論上帝揀選的與否，則都能沾惠；並且被揀選的未必比未被揀選的得到更多的恩典。乃正相反，世上邪惡的人，倒比敬虔的人得到更多的普通恩典和生來的普通福祉。例如路加福音裡的「財主……天天奢華宴樂。又有一個討飯的，名叫拉撒路，渾身生瘡，被人放在財主門口，要得財主桌子上掉下來的零碎充飢；……后來那討飯的死了，被天使帶去放在亞伯拉罕的懷裡。財主也死了，……在陰間受痛苦，……」（參路一六19一26）
2．可消除罪的刑罰──特殊恩典，可以消除世人的罪惡與罪刑，改變人的內心，藉著聖靈超凡的奇功，漸漸洗淨，從罪惡來的敗壞，其結果便使罪人得救。反之，普通恩典，不能除罪，亦不能使人性更新，僅能限製罪惡敗壞的力量與影響，減少罪的惡果，但卻不能使罪人得救。
3．乃是無可抗拒的──這並非說是一種決定性的力量，使人違反其意志，強迫其相信；而乃使其由衷的改變其心，甘心樂意，心悅誠服的接受主耶穌基督，順服上帝的旨意，得蒙救恩。反之，普通恩典乃是可拒絕的。使徒保羅在羅馬書裡說，關于上帝的事情，雖已顯明在人心裡，但世人，無論猶太人或外邦人卻「阻擋真理……，雖然知道上帝，卻不當作上帝榮耀他，也不感謝他」，而且「故意不認識上帝」，「任著……剛硬不悔改的心，為自己積蓄忿怒」。「不順從真理，反順從不義」（參羅一18、21、28，二5、8）。神學家謝特氏（W. G. T. Shedd）說︰「因為世人被罪捆綁不肯悔改，不能相信，所以普通恩典實在不足使其有悔改的心，從而得到救恩。」
4．是屬靈的再造的──特殊恩典乃是在人類心靈裡作工，能使人徹底改造，更新其整個的本性，故愿意接受主耶穌的救恩，從而結出屬靈的果子。反之，普通恩典的運行，則非在屬靈方面，而僅在理智和道德方面，使其有若干追求真理的心。質言之，其工作的性質，乃是自然的，非超自然的；是間接的，不是直接的；是平凡的，不能使其得救。
??? 阿敏念派卻不知分辨，以為普通恩典也有得救的作用。他們相信，靠著上帝的普通恩典，雖未重生的人，若不堅拒聖靈的工作，也可藉以作若干屬靈的善事，甚且悔改，皈信上帝，從而接受主耶穌基督得到救恩。關于這個問題，陶德教義大會（Synod of Dort）曾公布「陶德教規」（The Canons of Dort），加以駁斥，認為謬妄。