「起初上帝創造天地。地是空虛混沌，淵面黑暗；上帝的靈運行在水面上。」（創一1、2）
什么是聖靈有別于聖父和聖子的工作，我們首須加以明辨。
這並非說每一位基督信徒對于這些不同的特點都必須完全知道，因為信心的存在，並不是以理智的明辨為基礎。我們主要的問題，並不是在頭腦裡能夠深知聖父與聖子聖靈工作的不同，而乃在切身體驗他們恩工的運行。我們須務其「本」，不可僅知其「名」。
但是這又絕不是說，我們對于這些神聖之事，可以不求甚解，視為無關宏旨，無足輕重。也絕不是以為這些重大的事乃是皮毛的，我們大可不必鑽牛角尖；也不是拘泥小節，或小題大做，作無為的論辯，斤斤于細微末節。人類當運行他們的心力，探究每一部人生的問題。許多科學家用其畢生之力窮究草木昆虫，而且無微不至，引此為榮，且把每一器官，詳細推究，定出許多專門名詞。即在我們中國的《辭源》、《辭海》裡面，那時並無現在的所謂動物學，植物學，昆虫學各種課程，但是其中所有關于動植物的專門名詞，其數之繁多，乃不可勝數，誠令人驚異，此當由于上帝對于我國先祖之「普通啟示」（general revelation）。中外學者這樣的窮究精研，絕非浪費心力，鑽牛角尖，斤斤于細微末節，而乃為科學的研究。因為如不深思明辨，窮究精研，就不能有真知灼見；沒有真知灼見，則對于其研究的學科就不能有深徹的心得。則我們對于耶和華上帝，創造天地萬物的主，自當比對其被造之物的研究，更應集中心力加以窮究。
我們對其他門類的學科，既須深思明辨，則對于上帝的認識自更應求其精確深入，不可僅僅略知梗概，就淺嘗即止，庶免一知半解，混淆真道。何況上帝藉著普通啟示，賜給我們知識，使我們能夠認識上帝。他又藉著特殊啟示，更賜給我們他的話語，就是聖經，他的話又啟發我們，光照我們，「賜人智慧和啟示的靈，……使我們真知道他，並且照明我們心中的眼睛」（參弗一17、18），使我們能夠知道上帝的奧秘，他的屬性，和他的完善，他的德性，以及他存在的樣式。我們如果妄求，要想參透那沒有啟示我們的奧秘，固屬狂妄，一個敬畏上帝的虔誠聖徒當不應如此。但藉上帝的恩典與啟示，卻可以白白得著關于上帝深奧之事的知識。
準斯而論，關于聖靈有別于聖父聖子的工作之明辨，乃是正當的，而且必須的；並非咬文嚼字，斤斤細微末節。
但是關于這個問題，許多上帝的兒女，乃有各種混淆不清的見解，這是很可嘆息的。他們不能分辨聖父，聖子和聖靈的工作。雖然聖靈乃特別指稱是保惠師，但是他們大都只向聖父聖子求安慰，他們卻不能講保惠師的意義，也不能講為什么聖靈要特別稱為保惠師。
早期的教會深感明確分辨聖靈工作的需要，上帝所賜給教會的大思想家和基督教哲學家，尤其是東方教父，他們竭盡他們的心力，來研究這個問題。他們非常清楚了悟，除非教會知道了聖父，聖子和聖靈的分別，則他們對三一真神信仰的表白，等于空口說白話。他們為著教會逼切的需要，就致力于聖靈工作與聖父、聖子工作不同的研究。尤以教會因為異端邪說的紛爭，大受困擾，就激起他們的心志，研究上帝的話語。
所以我們並非首倡研究聖靈的工作，我們僅是把先賢著作歷代的光輝，繼續向教會發射，重新透進窗戶，從而使他們更深切了悟聖靈的奧秘，增加教會內在的力量。
先從其一般的分別說，每一樣工作乃受聖父，聖子，和聖靈共同的影響；但是使力量產生的，乃是聖父；使力量運行的，乃是聖子；使力量成全的，乃是聖靈。
哥林多前書第八章第六節清楚教訓我們，「……我們只有一位上帝，就是父，萬物都本于他，我們也歸于他；並有一位主，就是耶穌基督，萬物都是藉著他有的。」在此有兩個前置詞︰「本于」（of whom）和「藉著」（by whom）。在羅馬書十一章第三十六節又加一個前置詞「……萬有都是本于他，倚靠他，歸于他」（For of Him，and through Him and to Him are all thing）。
于此可知，上帝的工作，乃是三重的，第一萬有乃都從他而來，都「本于他」；萬有乃靠他而立，都「倚靠他」；萬有乃靠他達成其最后的目的，都「歸于他」。自第五世紀以后，教會裡偉大的先師，他們本此道理，把三一真神裡三個位格的工作，加以明辨，說萬有乃由聖父得到根源；萬有乃由聖子得以建立；萬有乃由聖靈達成最后的目的。
這些頭腦清楚的思想家傳講上帝工作的分別，乃是和他的位格（多數）一致的。天父上帝就是「父」，由他生「聖子」；而「聖靈」乃是由聖父，聖子而出。所以第一位格聖父的特征乃是很顯明，他不但是物質的天地萬物之根源，而且還是過去，現在和將來直到永遠的萬有所從出。第二位格聖子的特征，乃與聖父不同，他雖「在一切被造的以先」，「在萬有之先」；但從他和聖父的關系而說，他乃「是首生的」（參西一15∼17）「耶和華曾對我說︰『你是我的兒子，我今日生你。』」（詩二7）他乃是由天父所生的「子」。既然萬有乃從聖父而出，自然不能從聖子而出，萬有的根源並非在聖子。但是他既「在一切被造的以先。因為萬有都是靠他造的，無論是天上的，地上的；能看見的，不能看見的；或是有位的，主治的，執政的，掌權的；一概都是藉著他造的，又是為他造的。他在萬有之先；萬有也靠他而立。」（西一15∼17）可見萬有雖非由聖子所造卻「藉著他造」，「也靠他而立」。而聖靈雖非單獨由他而出，但乃是由聖父聖子而出。這乃是因為聖子和聖父乃是同質的。
聖經教訓我們，聖父乃是藉著聖子創造萬有，離開了聖子，就沒有被造之物。除了上文所引的歌羅西書一章十七節以外，希伯來書一章二、三節更清楚的說，「就在這末世，藉著他兒子曉諭我們，又早已立他為承受萬有的，也曾藉著他創造諸世界。他是上帝榮耀所發的光輝，是上帝本體的真像，常用他權能的命令托住萬有，他洗淨了人的罪，就坐在高天至大者的右邊。」這乃指示我們，萬有存在的本質，乃是由天父而來，他乃是萬有的泉源；但是要把萬有的成分來形成、組合，與精詳擘畫，乃為聖子特有的工作。
譬如一個君王要建築宮殿，這乃非僅僅需要材料。人工與計劃；而且還要把材料依照計劃，加以組合運用。君王供應材料，擬定計劃，而建築師就要依照計劃，建成宮殿。到底是誰建成的呢？既非君王，亦非單是建築師，而乃為建築師從君王的財寶中建造的。
此乃就人間的事例，來比擬上帝的工作，雖說比擬不倫，亦聊可藉此略窺上帝工作的一斑。藉著君王與建築師的關系，來推想聖父和聖子的關系。在創造天地萬物之時，乃有兩種作為︰其一是成因的（Causative），此乃供應材料，力量和計劃；其二是構成的（Constructive），此乃運用這些力量，照所定的計劃把材料加以整理組合。前者乃是由聖父，后者乃是由聖子；聖子乃是遵照聖父的旨意建造天地萬物。所以經雲︰「萬有也靠他而立」，「藉著他造」。（西一16、17）倘使聖父和聖子是獨立存在的，那就不能有這種合作，完成削世的大業。但是聖子既然是聖父所生的，因為「愛子是那不能看見之上帝的像，是首生的」（西一15），「是上帝榮耀所發的光輝，是上帝本體的真像」（來一3）；則在「上帝的本體」（Being）裡面，乃是不能有區分間隔的，乃僅有位格的不同而已。
這乃完全出于上帝的大能大智，但這創世的大工，尚未完全成就。被造之物不是造了以后成為一種裝飾的璧龕，是放在宇宙間的雕像。創世記二章三節，照一般的經文乃說，「到第七日，上帝造物的工已經完畢，就在第七日歇了他一切的工，安息了。」但照荷蘭文的譯本說，「……上帝在第七日歇了他一切的工，以備使其臻于完善。」這樣乃是要引領他被造之物到達最后的目標，使他們照其本性繼續發展，以期完善，此乃三位一體裡的聖靈上帝所特有的神聖偉大的奇工。
所以我們在本書開宗明義的首章，特別指出，此乃論及上帝和世人心靈深處最大的奧秘，實為一種非常微妙，神聖的奧秘，不易用文字語言完全闡明的，因此必須加以審慎的研討。